Desa Sidomukti berdiri pada tahun 1918 dan berdasarkan cerita dari para sesepuh bahwa Desa Sidomukti bermula dari penggabungan dari empat Desa yang sudah ada sebelumnya yaitu Desa Besokor, Desa Sidomukti, Desa Saren dan Desa Tuksuruh. Desa Besokor terdiri dari Sidomulyo dan Kampungbaru Dan Desa Sidomukti terdiri dari Sidomukti dan Krajan, Karena Desa yang sejak dulu selalu diduduki raja – raja atau pimpinan sedangkan Saren atau disebut Sareh ( istirahat ) dan pakis. Sedangkan Desa Tuksuruh atau disebut Surogung yang konon ceritanya ada seorang tokoh yang keberaniannya sangat besar sehingga disebut Surogung.
Penggabungan Keempat Desa ini terjadi pada tahun 1918 yang ditandai dengan proses pemilihan Lurah secara langsung oleh rakyat. Adapun Desa Sidomukti sejak tahun 1930 sampai sekarang telah terjadi beberapa kali kepemimpinan yang terbagi dalam beberapa periode.
Dan untuk data para Petinggi atau Kepala Desa dari awal sampai sekarang sejak berdirinya Desa Sidomukti adalah :
1. SINGO
2. WIRJAN
3. MARDAN
4. IMAM SOEMARYO
5. HESTU HANDOYO
6. KUYERI
7. MARTOYO
8. SUGIYANTO
9. PUJIONO