Desa NGERJO adalah Desa Kolonisasi yang datang dari beberapa Daerah di Jawa Tengah dan Jawa Timur, dan terdiri dari beberapa Daerah. Desa NGERJO pada mulanya adalah dari hutan kawasan Negeri, pada tahun 1937 datanglah penduduk kolonisasi sejumlah 45 KK dan sebanyak 135 jiwa, kemudian pada tahun 939 datang lagi sejumlah 60 KK sama dengan 460 jiwa, membuka dan menggarap tanah yang telah disediakan oleh pemerintah seluas 85 Ha.
Pada tahun 1937 kepala Desa dijabat oleh BP MUSTARI yang administrasinya mengikuti Desa Ngerjo pada tahun 1943/1944 diadakan pemilih Kepala Desa dan yang dipercaya untuk menjabat sebagai kepala Desa adalah Bpk Kasbun sampai dengan tahun 1945, yang selanjutnya dijabat oleh Bpk Kasbun. ( 1945-1948 ), pada tahun 1950 digantikan oleh Bpk Kasbun dengan carik/sekdes M HADIYANTO sampai dengan tahun 1963.
Pada tahun 1964 MUSTARI menjabat kepala Desa sampai tahun 1969, karena dalam menjalankan tugasnya kurang stabil maka digantikan oleh KASBUN sampai tahun 1979 kemudian Desa NGERJO terus berkembang dengan Kepala Desa :
Tahun (1979-1987) Bpk Kasbun dan Hadiyanto sebagai Sekdes
Tahun (1987-1998) Bpk Soemantri dan B Abdul Ghofur sebagai Sekdes
Tahun (1998-2002) Bpk Hudiyanto dan Abdul Ghofur sebagai Sekdes
Tahun (2002-2007) Bpk Slamet Sutejo dan Abdul Ghofur sebagai Sekdes
Tahun (2007-2008) Abdul Ghofur (Pj Kepala Desa)
Tahun (2008-2013) Bpk Saiful Bakri dan Abdul Ghofur sebagai Sekdes
Tahun (2013-2014) Slamet Sutejo dan Joko Suwito Sebagai Pj Kepala Desa
Tahun (2015-2017) Abdul Ghofur Sebagai Pj. Kepala Desa.
Tahun (2017-Sekarang) Bpk. Isnaeni Alnas Sebagai Kepala Desa.